1871年
米国婦人一致外国伝道協会より宣教師として派遣されたプライン,クロスビー,ピアソンが来日し,
横浜山手48番に横浜共立学園の前身であるアメリカン・ミッション・ホームを創立。女子教育およ
び混血児養育を開始する。 1881年 ピアソン・偕成伝道女学校が創立される。
1907年 偕成伝道女学校が共立女子神学校と改称される。後に,共立女子聖書学院と改称される。
後(1980年)に,共立女子聖書学院は他の二つの神学校と共に合同し,学校法人東京キリスト教
学園(千葉)となる。
1956年 単立教会として,共立女子聖書学院礼拝堂にて,横浜山手キリスト教会の礼拝が開始される。
初代牧師は,山口昇師。
1960年 二代目、森和亮師が牧師就任。
1969年 山手14番地(地蔵坂)に土地を購入。
1976年 旧会堂建設。
1979年 「日本福音長老教会」設立に参加。
1986年 金沢文庫伝道所(現日本長老教会・横浜金沢文庫キリスト教会)を開所。
1987年 富士霊園教会墓地(横浜金沢文庫キリスト教会との共同)が完成。
1993年 「日本福音長老教会」と「日本基督長老教会」が合同し、「日本長老教会」となる。
1994年 藤沢伝道所を開所(1999年閉鎖)。
2006年 三代目、三浦譲師(前鳴門キリスト教会牧師)を招聘、牧師就任。
2007年 森和亮師退任。
2008年 中区柏葉に牧師館購入。
2015年 教会隣接の森和亮師夫妻宅地が教会に寄贈される。
2017年 新会堂建設工事に伴い、旧会堂が解体され、旧森和亮師宅にて礼拝を行う。
2019年 新会堂建設。